Фонд является единственной российской неправительственной организацией за всю историю ЮНЕСКО (начиная с 1946 года), избранной в Комитет по связи НПО–ЮНЕСКО. За время работы в Комитете с 2018 по 2020 годы Фонд руководил тематической группой по вопросам климата и общественных инициатив, направленных на решение климатических проблем. Фондом создана «библиотека лучших практик» — информационный центр (Climate Initiatives Best Practices Clearing House) по различным общественным инициативам и проектам в разных странах, призванных решать климатическую повестку (включая вопросы загрязнения окружающей среды, обращения с отходами и формирование экологической культуры).

Фонд имени В.И. Вернадского участвует в работе Межведомственной рабочей группы при Администрации Президента Российской Федерации по вопросам, связанным с изменением климата и обеспечением устойчивого развития под руководством Советника Президента РФ по вопросам изменения климата, специального представителя главы Российского государства по вопросам климата Руслана Эдельгериева.

Начиная с 2016 года, Фонд является постоянным участником конференций ООН по вопросам климата (Конференции Сторон Рамочной конвенции ООН об изменении климата (РКИК ООН). В 2018 год Фонд получил статус организации-наблюдателя РКИК ООН.

В 2020 году Фонд им. В.И. Вернадского подписал Меморандум о деятельности Российского партнерства за сохранение климата и вошел в число его официальных партнеров. Российское партнерство за сохранение климата активно выступает на международной арене: его представители регулярно принимают участие в конференциях ООН по изменению климата, а само объединение оказывает влияние на климатическую повестку внутри России как единственное объединение компаний по климатической повестке.

С 2013 года Фонд активно взаимодействует с различными подразделениями, структурами и программами ЮНЕСКО, а также с Постоянными Представительством Российской Федерации при ЮНЕСКО и с Комиссией Российской Федерации по делам ЮНЕСКО (МИД России).

В 2015 году Фонд получил консультативный статус (статус привилегированного партнерства) при ЮНЕСКО. Фонд им. В.И. Вернадского является единственным официальным партнером российского комитета Программы ЮНЕСКО «Человек и биосфера» (РусМАБ).

Взаимодействие с Организацией Объединенных Наций

С 2003 года Фонд имеет консультативный статус при Экономическом и социальном совете ООН (ЭКОСОС ООН) и тесно сотрудничает с Информационным центром ООН в Москве.